人間ドックの受付病院・機関は日本人間ドック学会のホームページから調べる事ができます。
全国の人間ドック認定医、人間ドック健診情報管理指導医や人間ドック健診食生活改善指導士がいる施設や、人間ドック健診施設の180項目をクリアした認定ロゴマークを持つ人間ドック健診施設を全国の都道府県から探し出す事ができます。
また最新の人間ドックとしては、脳を含む全身をMRIの180スライス撮影での検査や、遺伝子レベルで疾病になる危険性をチェックできるプレミアコースもある、長野県長野市にある医療法人樹会「小林病院」（0120-110938予約／問い合わせ専用）。
人気テレビ番組「主治医が見つかる診療所」でも紹介されたMRI、マルチスライスCTを駆使した全身人間ドックや、日本人の三大死因と言われるがん、心臓疾患、脳卒中に直接アプローチする検査がある東京都八王子市の「八王子クリニック新町」（042-660-8846）。
ホテル並みの施設と、MRI、CT、マンモグラフィ等他の医療機関からの依頼検査実績も多い、東京都千代田区の医療邦人社団・あんしん会「四谷メディカルキューブ」（03-3261-0101）等があります。
また全国から、受診したい科別に探すことができる「人間ドックのここカラダ」というサイトもあります。